Największą zaletą Loadout jest system tworzenia broni, który oferuje graczom wielką swobodę w dobieraniu różnych jej części i właściwości. Gracze mogą tworzyć tyle broni, ile mają odblokowanych slotów. Jednak do jednej postaci mogą przypisać tylko dwie bronie i jedną broń dodatkową.
System tworzenia broni jest bardzo rozbudowany. Obecnie w grze można wykonać około 55 milionów kombinacji. W trakcie tworzenia broni można zmodyfikować dwanaście różnych elementów:
Spośród tych dwunastu kategorii, kilka z nich jest przedzielonych tylko do jednego typu broni (np. tylko wyrzutnia rakiet może korzystać z właściwości detonatora).
Pierwszą rzeczą, jaką należy zrobić jest wybór typu broni. Można wybrać tylko jeden typ spośród czterech szkieletów: strzelba, wyrzutnia, broń pulsacyjna, laser.
Po wybraniu typu broni tylko od ciebie zależy, jak będzie ona wyglądać. Każda kategoria (poza typem i celownikiem) ma większy, lub mniejszy wpływ na statystyki.